PROYECTO:

Descubrimiento de biomarcadores de potenciales probióticos para la industria camaronera ecuatoriana

INTRODUCCIÓN

Al momento, las enfermedades ocasionadas por vibrios patógenos son uno de los problemas más emergentes para la industria del camarón de cultivo. Por lo tanto, la búsqueda de nuevos métodos de control es de vital importancia para la sostenibilidad de la industria. El advenimiento de las nuevas tecnologías de secuenciación del ADN ha permitido que el biodescubrimiento de bacterias probióticas se realice en menor tiempo y con mayor confiabilidad. En este contexto, nuestra propuesta caracterizó el microbioma de larvas de camarón P. vannamei durante el ciclo de producción de una larvicultura comercial. El ADN bacteriano fue aislado y secuenciado por shotgun y metagenómica de amplicón 16S rRNA en una plataforma de secuenciación de alto rendimiento, para posteriormente los datos sean analizados por un flujo de trabajo bioinformático y estadístico. Luego de la presencia de un brote ocasionado por vibrios, los datos del microbioma de larvas procedentes de tanques que exhibieron alta y baja supervivencia fueron comparados. Nuestro principal hallazgo muestra biomarcadores asociados a la alta supervivencia, que podrían ser utilizados como potenciales probióticos para condiciones específicas de vibriosis. Una caracterización dependiente de cultivo microbiano descubrió dos aislados bacterianos con capacidad antagónica contra AHPND. Hasta el momento los resultados han sido publicados en una tesis de maestría, una tesis de pregrado, dos conferencias científicas en congresos y una revista de alto impacto (Frontiers in microbiology).

Objetivos:

General

Ejes de investigación 

• Eje 1: Análisis bioinformático y estadística inferencial del microbioma de P. vannamei.
• Eje 2: Biomarcadores de potenciales probióticos para camarón P. vannamei.

PRODUCTOS: TESIS, SUBPROYECTOS Y ARTÍCULOS

• Caracterización de la microbiota de cultivos larvarios de Penaeus vannamei afectados con la enfermedad de la necrosis aguda hepatopancreática (AHPND).
• Factibilidad de aplicar secuenciación de alto rendimiento para el descubrimiento de bacterias probióticas para larvas Penaeus vannamei.
• Microbiome of Penaeus vannamei Larvae and Potential Biomarkers Associated With High and Low Survival in Shrimp Hatchery Tanks Affected by Acute Hepatopancreatic Necrosis Disease